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成像处理

Image J

更新时间:2016-06-08 15:01   浏览: 次   作者:admin

软件介绍:
ImageJ 这套软件可以自动帮你你计算细胞数,也可以定量分析 DNA 电泳或是Western blot 条带。
数据处理方法:
一、定量分析DNA电泳条带
step 1.首先打开软件后,开启图档


step 2.请先做校正,选择 Analyze 底下的Calibrate 选项,再选择校正的模式,使用 Uncalibrate OD,按下 ok 之后会出现校正的图形


Step 3.在要分析的第一条(first lane)加上一个长型框(工具列第一个选项),再按下 Analyze/Gels/select first Lane 快速键(Ctr+1),此时框架中会出现一个号码 1,之后可以移动框架到第二个 lane 再选择 Analyze/Gels/select second Lane 快速键(Ctr+2),当然可以一直加下去,最后按 Analyze/Gels/plot Lanes 快速键(Ctr +3)。

Step 4.分析以后会出现图型表示你刚选择的框内的影像强度,此时可以看到有几个比较高的区段,就是我们想定量的 band,使用直线工具(工具列第五个选项)先将图形中高点为有 band 的区域和没有 band 的区域分开再,使用魔术棒工具(工具列第八个选项)点选要分析的区域。

Step 5.当我们点选分析时,在 result的对话视窗会出现分析的数据,依序点选就会出现每个 band 的值。


注:当我们选择分析的条带也可以是横向选取,就可以只比较相同大小的 DNA的含量,同样也可以应用在western blot 或其它类似实验条带的分析上。
二、定量分析Western blot条带
1.打开ImageJ并打开要分析的图片
2.把图像二值话或者设定阈值。选择Image - Adjust - Threshold... 根据提示设定你需要的阈值。这一步非常重要,关系到结果的正确性。设定阈值的标准就是把是颗粒的地方都突出出来。示例中颗粒都被染了红色。
3.菜单Analyze - Anelyze particles... 自动统计结果。





三、计算细胞数 
Step1. 打开软件,再开启要分析的图片(File->Open)。

step 2. 设定分析影像的阈值(Image->Adjust->Threshold,或快捷键 Ctr+Shift+T)

Step3. 调整阈值再按 set 决定。

Step4.选择 analyze particle(Analyze->Analyze particle) 并且记得要选择summarize,才会有分析的结果。

Step 5. 分析结果,可以看到原图像的视窗会出现电脑判读的数据,summary 会显示个数及分析影像的区域大小。

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